Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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