Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SRSF5Q13243 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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