Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms