Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms