Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD8P13378 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD8P13378 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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