Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RFXAPO00287 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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