Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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