Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SOBPA7XYQ1 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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