Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNS3Q9BQ31 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms