Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SAMD8Q96LT4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms