Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
C9orf135Q5VTT2 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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