Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RNF20Q5VTR2 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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