Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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