Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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