Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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