Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NRF1Q16656 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms