Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNCBQ16143 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNCBQ16143 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SNCBQ16143 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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