Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
ZFHX3Q15911 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
ZFHX3Q15911 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms