Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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