Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms