Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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VAMP3Q15836 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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VAMP3Q15836 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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