Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms