Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TAF1AQ15573 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TAF1AQ15573 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TAF1AQ15573 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms