Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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PTPRKQ15262 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRKQ15262 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
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