Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms