Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL4A6Q14031 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms