Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
GTF2H2Q13888 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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GTF2H2Q13888 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GTF2H2Q13888 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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