Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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