Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CUL1Q13616 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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CUL1Q13616 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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CUL1Q13616 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
CUL1Q13616 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CUL1Q13616 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CUL1Q13616 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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