Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SKP2Q13309 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SKP2Q13309 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKP2Q13309 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms