Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CLN3Q13286 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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