Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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