Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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