Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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