Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
BNIP3Q12983 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms