Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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