Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CHRNEQ04844 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms