Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FAM3AP98173 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FAM3AP98173 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FAM3AP98173 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms