Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRDP23468 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRDP23468 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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