Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRAP18433 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRAP18433 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRAP18433 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PTPRAP18433 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRAP18433 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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