Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DFFAO00273 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DFFAO00273 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DFFAO00273 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DFFAO00273 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DFFAO00273 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DFFAO00273 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DFFAO00273 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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