Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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