Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRPF3Q9ULD4 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms