Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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FOXQ1Q9C009 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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FOXQ1Q9C009 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FOXQ1Q9C009 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FOXQ1Q9C009 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXQ1Q9C009 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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