Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SAMD8Q96LT4 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms