Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms