Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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