Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms