Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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