Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPROQ16827 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPROQ16827 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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